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    曹慧芬

    • 讲师（高校）
    • 性别：女
    • 出生日期：1987-10-09
    • 毕业院校：Beijing Normal University
    • 学历：博士研究生
    • 学位：理学博士学位
    • 所在单位：华侨大学生物医学学院/分子药物研究院/医学院
    • 办公地点：泛华科技楼B201，厦门市集美区668号
    • 电子邮箱：
    • 在职信息：在岗
    • 职务：Assistant professor
    • 华侨大学2022年青年教师精彩一堂课三等奖（理工组））
    • 福建省首届研究生建模比赛（2022年）优秀奖（指导老师）
    • 华侨大学医学院2022年青年教授精彩一堂课一等奖
    • 华侨大学医学院2020年青年教授精彩一堂课二等奖
    • 华侨大学医学院2019年青年教授精彩一堂课二等奖
    • 华侨大学2020-2021学年优秀考核奖
    • 华侨大学2019-2020学年优秀考核奖

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    个人简介

    近年以来以第一作者、共同通讯作者在 Nature Communications、Molecular Plant、BMC Biology等期刊发表多篇研究论文，其中2022年以共同通讯作者在 Nature 子刊（IF 17）发表的论文是期刊生物方法学领域亮点文章，2019年在 Nature 子刊（IF 17）期刊发表的论文当选为当月亮点文章、仅一周时间就跻身生命科学领域2019年热文榜五十佳)。


    目前主要研究方向：

    1. 高精度的DNA损伤方法的开发以及其在哺育动物衰老、癌症等疾病中的应用研究，是目前的核心研究方向；

    2. 利用生物信息学方法研究lncRNA分子功能。


    个人详细简介：https://sbm.hqu.edu.cn/info/1166/5429.htm

     欢迎有生物或计算相关背景的学生报考我的研究生！

    研究领域

  • 利用生物信息学方法研究lncRNA分子功能

  • 高精度的DNA损伤方法的开发以及其在哺育动物衰老、癌症等疾病中的应用研究

    • 教育经历

    [1] 2007.8 -- 2011.6
    兰州大学       数学与统计学院       本科(学士)       理学学士学位

    [2] 2011.9 -- 2016.6
    北京师范大学       生物信息学       博士研究生毕业       理学博士学位

    工作经历

    [1] 2017.1 -- 至今
    华侨大学      医学院      讲师（硕士生导师）      在岗

    科研项目

  • [1]拓扑异构酶抑制剂诱导的癌细胞DNA断裂介导基因表达调控机理的研究,在研（主持）,国家自然科学基金委员会,

  • [2]人类基因组中与年龄相关的DNA损伤特征研究,在研（主持）,

  • [3]拓扑异构酶抑制剂诱导人类癌细胞DNA断裂介导基因表达调控机制的研究,在研（主持）,

  • [4]极长非编码RNA的功能注释平台的构建,结项（主持）,

  • [5]整合RNA-Seq分析的植物基因组注释系统研究--以黄瓜属近缘基因组进化分析为例,国家自然科学基金委员会,

  • [6]基于核酶剪切产物的特异性应用Helicos DRS测序技术发现新核酶的研究,结项,国家自然科学基金委员会,

  • [7]参与抗癌药物作用及耐药性的vlincRNA调控网络研究,在研（参与）,

  • [8]衰老相关的人和小鼠全基因组核苷酸水平SSB和AP损伤机理研究——基于DNA损伤检测SSiNGLe方法的拓展和应用,在研（参与）,国家自然科学基金,

    • 获奖信息

  • 华侨大学医学院2022年青年教授精彩一堂课一等奖

  • 华侨大学医学院2020年青年教授精彩一堂课二等奖

  • 华侨大学医学院2019年青年教授精彩一堂课二等奖

  • 福建省首届研究生建模比赛（2022年）优秀奖（指导老师）

  • 华侨大学2022年青年教师精彩一堂课三等奖

  • 华侨大学2020-2021学年优秀考核奖

  • 华侨大学2019-2020学年优秀考核奖

    • 论文成果

  • [1]Positive selection and functional divergence of R2R3-MYB paralogous genes expressed in inflorescence buds of Scutellaria species (Labiatae).International Journal of Molecular Sciences,

  • [2]A CRISPR/Cas13-based approach demonstrates biological relevance of vlinc class of long non-coding RNAs in anticancer drug response.Scientific Reports,

  • [3]Single nucleus genome sequencing reveals high similarity among nuclei of an endomycorrhizal fungus.PLoS Genetics,

  • [4]Standing genetic variation as the predominant source for adaptation of a songbird.Proc Natl Acad Sci USA,

  • [5]Hovlinc is a recently evolved class of ribozyme found in human lncRNA.Nature Chemical Biology,

  • [6]Hierarchical Map of Orthologous Genomic Regions Reconstructed from Two Closely Related Genomes: Cucumber Case Study.The Plant Genome,

  • [7]Hotspots of single-strand DNA "breakome" are enriched at transcriptional start sites of genes.Frontiers in Molecular Biosciences,

  • [8]Methods to Analyze the Non-Coding RNA Interactome-Recent Advances and Challenges.Frontiers in Genetics,

  • [9]Very long intergenic non-coding (vlinc) RNAs directly regulate multiple genes in cis and trans.BMC Biology,

  • [10]The Genome of Medicinal Plant Macleaya cordata Provides New Insights into Benzylisoquinoline Alkaloids Metabolism.Molecular Plant,

  • [11]Strategies to Annotate and Characterize Long Noncoding RNAs: Advantages and Pitfalls.Trends in Genetics,

  • [12]Novel approach reveals genomic landscapes of single-strand DNA breaks with nucleotide resolution in human cells.Nature Communications,

  • [13]Complex genomic patterns of abasic sites in mammalian DNA revealed by a high-resolution SSiNGLe-AP method.Nature Communications,

    • 授课信息

  • [1]医学统计学

  • [2]生物信息学

  • [3]#生物统计学

  • [4]互联网+：引论

    • 其他联系方式

    通讯/办公地址 :

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